非转基因大豆是通过自然界优胜劣汰选择基因的结果。
转基因大豆指的是将某些物种所呈现出优秀性状的基因，转入可满足人类生存需求的动、植物、微生物基因组中，以使物种表现出其自身缺乏的优秀性状。在基因转入过程中，由于不可预见的基因突变，可能会转化为会对人体产生危害的有毒蛋白质等诸多因素，所以涉及到转基因的安全问题。
20世纪80年代，孟山都公司研究人员从矮牵牛中克隆获得了抗性基因(EPsPs基因)，并应用粒介导转移脱氧核糖核酸(DNA)技术，将矮牵牛质粒(caMv)中35s启动子控制EPsPs基因导入大豆基因组中，进而培育出抗草甘膦大豆品种。这种转基因大豆于1994年被美国食品与药品管理局(FDA)批准，较早成为商业化大规模推广的生产转基因作物之一。由于RR豆具有耐除草剂草甘膦基因，这种大豆对非选择性除草剂农达(Rwndup)有高度耐受性。在大田中施用草甘膦除草剂，不会影响大豆产量。此外，转基因大豆还有其他类型，如高蛋氨酸大豆品种等，但转基因大豆的毒性和安全隐患问题一直备受争议。
下面就简单介绍一下区分二者的办法。
一、从外观上来看黄豆的大小
非转基因的大豆，没有那么的均匀颗粒，有大有小有扁有厚，有的饱满有的奇形怪状的，歪的长的。
转基因的大豆，因为基因温度，所以产量非常的高，大小基本相同。
二、从颜色上辨别
非转基因大豆，因为是自然生长的原因，可能会有时间上的差异有的成熟了，而有的没有成熟，有的长的比较饱满，有的长的没有成熟比较小，晾干的黄豆也会有些发青，颜色不一。
转基因的大豆，因为经营温度的原因成熟的比较快，所以基本上，转基因的大豆颜色是一致偏黄，而且颜色比较均匀。
三、大豆的肚脐
自然生长的大豆肚脐大小不一，而且有一条白色的链牙缝，那个牙缝就是发芽冒出来的地方，而且肚脐眼呈色是咖啡色，而且有深有浅。
转基因的大豆肚脐以大豆的颜色基本一致没有异常颜色。
四、从形状上辨别
如果是通过生物科技技术手段，来转移的大豆品种，它的大小以及形状基本是，没太大差异，转基因的大豆是呈正圆形的，而非转基因的大豆是圆形或者椭圆形的，而且大小不一。
五、虫蛀痕迹
由于转基因大豆，培育目的是抗虫，抗药，所以分辨方法应该从这一特点出发，一般非转基因的大豆，偶尔能看到虫蛀的痕迹。而转基因的大豆通常形态整洁，几乎看不到任何虫蛀痕迹。
